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- pdb文件如何打开? - 知乎
在对PDB( pdb)文件进行操作时,有时仅需要保留蛋白链、核酸链、配体、或者水。 除了直接在文本文档格式下或者coot中对PDB文件中其他信息进行删除,还可以通过命令行的形式来提取,这种方法简便且不改变原PDB文件,避免出现误操作的情况。
- 有没有生物大佬教教我PDB是什么啊?在线等,挺急的!!谢谢辽? - 知乎
PDB门口的显示屏,摄于2019年 从左上角的世界地图可以看出,网站的访客遍布全世界。右侧罗列了访问最多的十个的美国城市(第一名是 纽约)和访问最多的十个非美国城市(第一名是佛山)。 下方的EMD-9987,则是该网站最近发布的结构。
- 如何获得一个蛋白质的PDB编号? - 知乎
问题不清楚:我理解你的问题是 1)我想知道一个 蛋白质 的 空间结构,想查查pdb,但是不知道编号。 这个好办,不需要知道 pdb编号。直接查蛋白质的名字,其他通用的ID就行了。一个蛋白质,视重要程度和实验难度,可能有从几个到上千又或者根本没有结构信息,所以蛋白质和pdb是一对多的关系
- 有谁在RCSB PDB网站下载过蛋白质的pdb文件?怎样从这个网站中下载到某一聚合物中某一个组成部分的pdb文件? - 知乎
有谁在RCSB PDB网站下载过蛋白质的pdb文件? 怎样从这个网站中下载到某一聚合物中某一个组成部分的pdb文件? 例如由actin何frofilin两种蛋白质通过binding 形成complex,能不能找到complex中actin的pdb文件 关注者 10
- pymol如何保存成pdb格式? - 知乎
pymol如何保存成pdb格式? 我用pymol 处理多肽后不知道怎样保存为pdb了 显示全部 关注者 12 被浏览
- pdb蛋白库如何搜索想要的蛋白质? - 知乎
将蛋白质pdb与 适配体pdb 对接时会出现报错,提示蛋白质pdb有问题,我是在RCSB网站下载的蛋白pdb,是需要进行什么处理,才能在用于对接的时候不报错吗?
- pymol如何保存成pdb格式? - 知乎
pdb格式 图片取自:pdbintro 其次,我们需要知道Pymol中显示颜色的方式。Pymol有各种显示颜色的方案,我们这次会利用其能够根据b-factor上色的功能。 Pymol操作为:color选项 >> spectrum >> b-factors 我们第一步要生成一个9x9x9的格子。
- 米内和上海医工院PDB(医药地理)哪个医药数据库更好? - 知乎
目前在医药数据领域是以药融云、insight、医药魔方、米内、药渡等医药数据库为代表。 其中米内隶属于广州标点医药信息有限公司,于2010年正式上线;而上海医工院PDB隶属于上海数图健康医药科技有限公司,于2011年上线;这两个数据库都有各自的优缺点。
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