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  • 有谁在RCSB PDB网站下载过蛋白质的pdb文件？怎样从这个网站中下载到某一聚合物中某一个组成部分的pdb文件？ - 知乎
    有谁在RCSB PDB网站下载过蛋白质的pdb文件？ 怎样从这个网站中下载到某一聚合物中某一个组成部分的pdb文件？ 例如由actin何frofilin两种蛋白质通过binding 形成complex,能不能找到complex中actin的pdb文件 关注者 10
  • pdb文件如何打开？ - 知乎
    在对PDB（ pdb）文件进行操作时，有时仅需要保留蛋白链、核酸链、配体、或者水。 除了直接在文本文档格式下或者coot中对PDB文件中其他信息进行删除，还可以通过命令行的形式来提取，这种方法简便且不改变原PDB文件，避免出现误操作的情况。
  • 有没有生物大佬教教我PDB是什么啊？在线等，挺急的！！谢谢辽？ - 知乎
    PDB门口的显示屏，摄于2019年 从左上角的世界地图可以看出，网站的访客遍布全世界。右侧罗列了访问最多的十个的美国城市（第一名是纽约）和访问最多的十个非美国城市（第一名是佛山）。 下方的EMD-9987，则是该网站最近发布的结构。
  • pymol如何保存成pdb格式? - 知乎
    pdb格式 图片取自：pdbintro 其次，我们需要知道Pymol中显示颜色的方式。Pymol有各种显示颜色的方案，我们这次会利用其能够根据b-factor上色的功能。 Pymol操作为：color选项 >> spectrum >> b-factors 我们第一步要生成一个9x9x9的格子。
  • 请问已知蓝色绿色两个蛋白的pdb文件，怎么用pymol画出这样的图形? - 知乎
    请问已知蓝色绿色两个蛋白的pdb文件，怎么用pymol画出这样的图形? [图片] 图片的蓝色和绿色是两个蛋白，pdb文件可以下载到。 用pymol怎么画出这样的图形呢？ 显示全部 关注者 2 被浏览
  • 如何获得一个蛋白质的PDB编号？ - 知乎
    这个好办，不需要知道pdb编号。 直接查蛋白质的名字，其他通用的ID就行了。 一个蛋白质，视重要程度和实验难度，可能有从几个到上千又或者根本没有结构信息，所以蛋白质和pdb是一对多的关系。 2）你自己解出蛋白质结构，想得到一个pdb编号。
  • pdb是什么文件格式? - 知乎
    在最基本的层面上， PDB 文件是原子和笛卡尔 (XYZ) 坐标的列表。相同的格式可用于表示任何物理对象。包含其他信息以提供有关原子的更多详细信息，以及将原子构建成氨基酸、将氨基酸（残基）构建成蛋白质以及将蛋白质构建成大分子。跳过第一列，第二列是顺序原子数。接下来，是原子符号
  • 从 Alphafold 蛋白质结构数据库下载 PDB文件 - 知乎
    从 Alphafold 蛋白质结构数据库下载 PDB文件 发布于 2021-10-29 04:01 · 7764 次播放 举报 蛋白质结构 数据库 蛋白质 结构生物学 测序 计算机辅助药物设计




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