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  • 保姆级KEGG数据库教程！医学人如何入门KEGG？信号通路分析必学功能有哪些？不需要掌握的有哪些？
    1 KEGG PATHWAY 这部分应该就是大家最熟悉的啦，也是KEGG数据库最核心的部分。 它包含了与通路相关的各种信息，我们解螺旋也有相关课程教大家使用，在此就不赘述。 2 KEGG BRITE 这部分是一个手动创建的分层文本文件的集合，捕获各种生物对象的功能层次结构。
  • 为啥目标基因在kegg富集分析时，没有kegg pathway通路，只有kegg brite中的一个？ - 知乎
    在进行KEGG富集分析时，如果发现目标基因只富集到了KEGG BRITE分类而不是经典的KEGG pathway，这可能意味着以下几种情况： 1 数据特异性： 你的基因集可能富含一些较为新颖或特定生物学功能的基因，这些功能可能还未被详细归纳到传统的KEGG pathway中，而是更多体现在KEGG BRITE分类里。KEGG BRITE是一个
  • KEGG 怎么用？ - 知乎
    9 KEGG NETWORK 这部分和上面的KEGG DISEASE比较像，它是KEGG尝试从扰乱的分子网络中获取有关疾病和药物的信息。这部分主要包含了癌症、内分泌和代谢性疾病、病毒和细菌感染三部分内容。 10 KEGG DRUG 这部分包含的药物为在日本和美国上市的药物。大家可以在上面的搜索框进行搜索或者查看下面的药物
  • 在KEGG分析中，富集到的Pathway比较少（个位数），怎么办？ - 知乎
    在 KEGG 分析中出现符合 q 值 < 0 50 的富集 Pathway 数量较少的情况，可以考虑以下几种方法来优化和展示结果： 回顾数据预处理步骤，确保基因表达数据、差异基因筛选等过程准确无误，避免因数据质量问题导致富集结果不理想。
  • 大佬们，请问KEGG共富集后，有很多通路如何选择关键通路？？？ - 知乎
    大佬们，请问KEGG共富集后，有很多通路如何选择关键通路？ ？？ 大佬们，有没有人知道植物组织送样后，数据回来的转录，蛋白，代谢多组学联合分析的KEGG共富集有十多天通路，如何确定关键的研究通路？ 还有关键蛋白，代谢物… 显示全部 关注者 3 被浏览
  • 单细胞测序中GO、KEGG、GSEA 分析三个高级分析有什么区别？ - 知乎
    单细胞测序中GO、KEGG、GSEA分析是三种常用的高级分析方法，它们各有特点和应用场景，以下是它们的主要区别： GO分析 1 定义与目的： Gene Ontology（GO）是一个国际标准化的基因功能分类系统，旨在对基因和蛋白质的功能进行限定和描述。
  • GO和KEGG分析怎么筛选自己想要的基因啊? - 知乎
    GO（Gene Ontology）和KEGG（Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes）是常用的基因功能注释和通路分析工具。 如果想筛选自己想要的基因进行GO和KEGG分析，可以按照以下步骤进行： 获取基因列表：从文献、数据库或实验中获取感兴趣的基因列表。
  • kegg气泡图能看出通路是上调还是下调吗？ - 知乎
    KEGG气泡图本身并不直接显示通路是上调还是下调。 气泡图主要用于展示基因在特定通路中的富集情况，通常通过富集程度（如富集比值Rich factor、q值或-log10 (p值)）和基因数量来表示。




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